Awal Berdiri
Sejarah SMA Katolik Frateran Ndao Ende dimulai pada tahun 1989. Pendiriannya merupakan hasil alih fungsi dari Sekolah Pendidikan Guru (SPG) Ndao Ende yang telah berdiri sejak tahun 1943. Pengalihan fungsi ini secara resmi disahkan melalui tiga Surat Keputusan dari DEPDIKBUD Propinsi NTT, Dirjen DIKDASMEN, dan Yayasan Mardi Wiyata Pusat pada tahun 1988. Selanjutnya, pada bulan Juli 1989, SMA Katolik Frateran Ndao secara resmi membuka pendaftaran siswa baru. Angkatan perdananya dipimpin oleh Kepala Sekolah pertama, Frater M. Amatus BHK, dan tercatat sebanyak 135 siswa. Meskipun pada awalnya jumlah siswa sedikit dan menimbulkan keraguan, Frater M. Amatus BHK berhasil memotivasi seluruh guru dan staf, sehingga dari tahun ke tahun jumlah siswa terus meningkat.
Tonggak Kepemimpinan SMATER Ndao
Sejak saat itu, SMATER NDAO Ende telah dinakhodai oleh beberapa Kepala Sekolah yang berdedikasi:
Frater. M. Amatus, BHK : Tahun 1989 – 1995
Frater. M. Bernardus, BHK : Tahun 1995 – 2001
Frater. M. Gaudensius, BHK : Tahun 2001 – 2003
Frater. M. Damianus, BHK: Tahun 2003 – 2006
Frater. M. Sarto, BHK : Tahun 2006 – 2016
Frater. M. Wilhelmus Satel Sura BHK, S.Pd, MM : Tahun 2016 – 2022
Frater. M. Vinsensius Tnopo,S.Pd : Tahun 2016 – 2022
Frater. M. Albertus Sukatno, M.Ag : Tahun 2024 – Sekarang
Prestasi dan Pengakuan
Selain perkembangan jumlah siswa, sejarah prestasi SMATER NDAO Ende telah mengukir berbagai prestasi gemilang, meskipun tergolong sekolah muda. Sejak berdiri, sekolah telah menamatkan lebih dari 5.000 alumni yang tersebar di berbagai bidang dan wilayah. Oleh karena itu, berbagai penghargaan dan pengakuan juga telah diraih, menunjukkan komitmen sekolah dalam memenuhi Standar Nasional Pendidikan:
Akreditasi “A”: Diterima pada tahun 2006 dan kembali diperbarui dengan nilai 98,06 pada tahun 2011.
Sekolah Standar Nasional (SSN): Ditetapkan sebagai calon SSN pada tahun 2008.
Sekolah Model Nasional: Dipilih sebagai salah satu dari 132 Sekolah Model di Indonesia pada tahun 2010.
Sekolah Induk Klaster Kurikulum 2013: Ditunjuk sebagai pusat sosialisasi dan pelatihan Kurikulum 2013 pada tahun 2014.
Penerapan Kurikulum 2013: Menerapkan Kurikulum 2013 secara bertahap dan bahkan telah menerapkan Sistem Kredit Semester (SKS) sejak tahun 2014/2015.
Sekolah Rujukan Kurikulum 2013: Ditunjuk sebagai sekolah rujukan untuk pelaksanaan Kurikulum 2013 di Kabupaten Ende pada tahun 2016.
Visi Sekolah
Terwujudnya peserta didik yang berprofil pelajar Pancasila berwawasan lingkungan, berjiwa enterpreneur dan unggul dalam IPTEK dijiwai semangat HATI yang JUJUR (Jenius, Ulet, Juang, Unggul, Religius).
Moto Sekolah
Raih Prestasi, Jujur Harga Mati Maju Bersama Hebat Semua
Spirit Sekolah
Sekolahku Rumahku, Guruku Orang Tuaku, Siswaku Anakku
Misi Sekolah
- Terwujudnya peserta didik yang beriman, bertaqwaa kepada Tuhan Yang Maha Esa dan berakhlak mulia
- Terwujudnya peserta didik yang berkebhinekaan global
- Terwujudnya peserta didik yang memiliki semangat gotong royong
- Terwujudnya peserta didik yang mandiri
- Terwujudnya peserta didik yang bernalar kritis
- Terwujudnya peserta didik yang kreatif
- Terwujudnya peserta didik yang berwawasan lingkungan
- Terwujudnya peserta didik yang berjiwa ienterpreneur
- Terwujudnya peserta didik yang adaptif dan inovatif terhadap perkembangan IPTEK.
- Terwujudnya peserta didik yang memiliki semangat hati yang jujur

